我国民营经营主体的组织形式主要包括：公司（有限责任公司和股份有限公司）、合伙企业（普通合伙企业和有限合伙企业）、个人独资企业、个体工商户四种类型。各种形式凭借各自的优势满足创办者的不同需求，亦各自存在不可忽视的局限性。创业者应根据自身发展阶段和商业模式选择适当的经营主体类型，必要时可将多种形式的经营主体配合使用。
个体工商户是我国最为常见的经营主体形式，适用于街边餐饮、零售、理发、服装、五金等小型商业形态。其优势在于税收优惠政策优厚：小规模纳税人月销售额低于10万元、年销售额低于120万元的免征个人所得税；小规模纳税人增值税普通发票月销售额低于15万元、年销售额低于180万元的免征增值税；增值税暂按1%征收，附加税减半征收。在特定税收洼地园区注册的个体工商户还可享受核定征收政策，综合税率不超过3%。
个体工商户的缺陷同样突出：个体工商户不具有独立法人资格，全部财产属于经营者个人所有，经营者须对个体工商户的债务承担无限连带责任；且个体工商户不能转让主体资格（只能转让资产），难以形成品牌溢价和经营主体溢价。
个人独资企业的税收地位与个体工商户相似，仅缴纳个人所得税，不缴纳企业所得税。个人独资企业500万元以内年销售额免征增值税。但其同样不具备独立法人资格，投资者须承担无限责任。个人独资企业依附于投资者个人，难以通过社会公允的价值评估体系评估企业价值，退出和变现成本较高。
合伙企业近年来广泛应用于股权激励平台和投资平台。其税收地位为仅缴纳个人所得税（按经营所得适用累进税率），不缴纳企业所得税。合伙人人数上限为50人。
合伙企业的核心制度优势在于区分普通合伙人和有限合伙人：普通合伙人执行合伙事务并对合伙债务承担无限连带责任，有限合伙人不执行合伙事务且以其认缴的出资额为限承担有限责任。这一区分使合伙企业能够在有限合伙人不参与经营的前提下实现控制权与出资额的分离，特别适合作为员工股权激励的持股平台。
合伙企业的局限性在于其非法人主体资格，在市场经济交易中难以获得与公司同等的认可，因此更多用于内部组织架构（持股平台、投资平台等），而非用于对外开展主营业务。
公司是最规范的经营主体形式。股东对公司债务承担有限责任（完成出资义务后无需承担额外责任）；公司的股权可用以分配利润、吸引资金和人才，满足公司发展过程中对资金和人才的需求；公司受到严格的法律法规约束，常规问题在法律框架内有成熟的解决路径；公司可以通过税收、知识产权等被市场公认的方式核算价值，便于估价和转让。
公司的劣势在于税费成本相对较高（至少多于合伙企业和个人独资企业一项企业所得税）以及管理成本（财税和人力合规成本）较大。但综合评估，公司仍是创业的优先选择。
规避法律风险应采用公司形式作为实际运营主体；股权激励和持股平台宜采用有限合伙企业形式；税务筹划可采用个人独资企业和个体工商户形式。多种主体形式的组合运用，是实践中较为成熟的企业架构方案。